Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPOPA6NHQ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPOPA6NHQ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOPA6NHQ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms