Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN8A6NHC0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN8A6NHC0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN8A6NHC0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms