Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP2A4UGR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XIRP2A4UGR9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms