Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCHNA4D1U4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms