Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F8A0AVK6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms