Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YXV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0J9YXV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0J9YXV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms