Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087X1B8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms