Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms