Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms