Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRBP1Q9P2E9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms