Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DMRT3Q9NQL9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DMRT3Q9NQL9 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms