Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms