Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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