Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CNPPD1Q9BV87 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms