Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM175Q9BSA9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms