Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms