Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIN3AQ96ST3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SIN3AQ96ST3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms