Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN18Q96SJ8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms