Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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