Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX27Q96L92 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms