Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RYBPQ8N488 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RYBPQ8N488 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms