Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms