Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms