Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CCDC144NLQ6NUI1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms