Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CTXN3Q4LDR2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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