Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms