Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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