Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ATP6AP1Q15904 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6AP1Q15904 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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