Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TAF13Q15543 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TAF13Q15543 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TAF13Q15543 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TAF13Q15543 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TAF13Q15543 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms