Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms