Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms