Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms