Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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DDX39BQ13838 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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