Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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