Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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