Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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