Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EP300Q09472 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms