Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms