Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FMODQ06828 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms