Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COG7P83436 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COG7P83436 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms