Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms