Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms