Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms