Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFC1P60507 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms