Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOSBP53539 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOSBP53539 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOSBP53539 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms