Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms