Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLCP48506 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms