Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIP4K2AP48426 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms