Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCC3P46736 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms