Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPARGP37231 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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